La Escuela Especial San Mateo, en su calidad de escuela especial, tiene como misión entregar, considerando las características y capacidades de sus alumnos y alumnas las herramientas necesarias para desarrollar sus potencialidades y habilidades, con el fin de formar personas integras, que desarrollen valores, hábitos, conductas, destrezas y fortalezas, en un ambiente participativo, fundamentado en el respeto y la tolerancia, considerando a la familia como pilar fundamental para el logro de las metas y objetivos propuestos por el establecimiento.